Preriscaldare il forno a 185–190 °C e preparare una pirofila (30 cm × 40 cm).
Sbucciare la carota e la cipolla e tagliarle a cubetti piccoli insieme alla zucchina e al sedano.
Preparare una ciotola capiente, aggiungere le verdure tagliate, il riso precotto, la scorza di limone, il parmigiano grattugiato, 400 ml di latte, la farina, il timo, il tonno, 2 cucchiai di olio d'oliva, sale e pepe e mescolare tutto.
Versare il composto nella pirofila e cuocere per 50–55 minuti a 185–190 °C.
Dopo la cottura estrarre la pirofila dal forno, dividere il tonno gratinato in porzioni individuali e servire.