Preriscaldare il forno a 190 °C, preparare una teglia e rivestirla con carta da forno.
Sbucciare gli scalogni e tagliarli in quarti, tagliare la zucchina e la melanzana a cubetti e tagliare i pomodorini a metà.
Mescolare le verdure tagliate in una ciotola con 2 cucchiai di olio d'oliva, il timo essiccato, l'origano, un pizzico di sale e un pizzico di pepe. Mettere da parte la ciotola per il momento.
In una pentola capiente iniziare a scaldare una quantità sufficiente di acqua per cuocere gli spaghetti (circa 5 l).
Poco prima che l'acqua raggiunga l'ebollizione, trasferire le verdure dalla ciotola sulla teglia preparata e cuocere nel forno preriscaldato per 20–25 minuti a 180–190 °C. Quando l'acqua nella pentola bolle, salarla, aggiungere gli spaghetti e cuocerli seguendo le istruzioni sulla confezione (i tempi di cottura per la pasta senza glutine sono di circa 8–12 minuti).
Mescolare le verdure al forno con gli spaghetti cotti, dividere in 4 porzioni, cospargere ogni porzione con scaglie di parmigiano e servire.
