Prima di tutto preriscaldate il forno a 195–200 °C, preparate uno stampo per 12 muffin e rivestitelo con i pirottini di carta.
In una ciotola capiente mettete il formaggio cottage, le uova, il latte parzialmente scremato, i fiocchi d'avena, i gambi di cipollotto, gli spinaci, il timo, il sale e il pepe e mescolate accuratamente il tutto. Con un cucchiaio riempite i pirottini preparati con il composto ottenuto fino a circa ¾ del loro volume.
Una volta riempito lo stampo per muffin, battetelo più volte sul piano di lavoro per eliminare le bolle d'aria in eccesso. Dopodiché inserite lo stampo nel forno preriscaldato e cuocete per 20–22 minuti a 195–200 °C.
Dopo la cottura lasciate raffreddare i muffin per almeno 15 minuti, quindi servite.